Abstract
Approaches exploiting trait distribution extremes may be used to identify loci associated with common traits, but it is unknown whether these loci are generalizable to the broader population. In a genome-wide search for loci associated with the upper versus the lower 5th percentiles of body mass index, height and waist-to-hip ratio, as well as clinical classes of obesity, including up to 263,407 individuals of European ancestry, we identified 4 new loci (IGFBP4, H6PD, RSRC1 and PPP2R2A) influencing height detected in the distribution tails and 7 new loci (HNF4G, RPTOR, GNAT2, MRPS33P4, ADCY9, HS6ST3 and ZZZ3) for clinical classes of obesity. Further, we find a large overlap in genetic structure and the distribution of variants between traits based on extremes and the general population and little etiological heterogeneity between obesity subgroups.
| Original language | English |
|---|---|
| Pages (from-to) | 501-512 |
| Number of pages | 12 |
| Journal | Nature Genetics |
| Volume | 45 |
| Issue number | 5 |
| DOIs | |
| Publication status | Published - 7 Apr 2013 |
| Externally published | Yes |
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Dive into the research topics of 'Genome-wide meta-analysis identifies 11 new loci for anthropometric traits and provides insights into genetic architecture'. Together they form a unique fingerprint.Cite this
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In: Nature Genetics, Vol. 45, No. 5, 07.04.2013, p. 501-512.
Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
TY - JOUR
T1 - Genome-wide meta-analysis identifies 11 new loci for anthropometric traits and provides insights into genetic architecture
AU - Berndt, Sonja I.
AU - Gustafsson, Stefan
AU - Mägi, Reedik
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PY - 2013/4/7
Y1 - 2013/4/7
N2 - Approaches exploiting trait distribution extremes may be used to identify loci associated with common traits, but it is unknown whether these loci are generalizable to the broader population. In a genome-wide search for loci associated with the upper versus the lower 5th percentiles of body mass index, height and waist-to-hip ratio, as well as clinical classes of obesity, including up to 263,407 individuals of European ancestry, we identified 4 new loci (IGFBP4, H6PD, RSRC1 and PPP2R2A) influencing height detected in the distribution tails and 7 new loci (HNF4G, RPTOR, GNAT2, MRPS33P4, ADCY9, HS6ST3 and ZZZ3) for clinical classes of obesity. Further, we find a large overlap in genetic structure and the distribution of variants between traits based on extremes and the general population and little etiological heterogeneity between obesity subgroups.
AB - Approaches exploiting trait distribution extremes may be used to identify loci associated with common traits, but it is unknown whether these loci are generalizable to the broader population. In a genome-wide search for loci associated with the upper versus the lower 5th percentiles of body mass index, height and waist-to-hip ratio, as well as clinical classes of obesity, including up to 263,407 individuals of European ancestry, we identified 4 new loci (IGFBP4, H6PD, RSRC1 and PPP2R2A) influencing height detected in the distribution tails and 7 new loci (HNF4G, RPTOR, GNAT2, MRPS33P4, ADCY9, HS6ST3 and ZZZ3) for clinical classes of obesity. Further, we find a large overlap in genetic structure and the distribution of variants between traits based on extremes and the general population and little etiological heterogeneity between obesity subgroups.
UR - https://www.scopus.com/pages/publications/84878594902
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M3 - Article
C2 - 23563607
AN - SCOPUS:84878594902
SN - 1061-4036
VL - 45
SP - 501
EP - 512
JO - Nature Genetics
JF - Nature Genetics
IS - 5
ER -